Fylogenetický strom &Lyme Disease

Lymská choroba je utrpenie spôsobené baktériou Borrelia burgdorferi , patogénu prenášané kliešťami blacklegged . Ako s mnohými inými patogénmi , biológovia boli schopní rozlúštiť trochu B. burgdorferi v evolučnej histórii genetickú analýzou . Fylogenetický strom pre baktérie , ako je B. burgdorferi poskytuje vizuálne znázornenie svojich vzťahov s ostatnými kmeňmi a druhmi . Fylogeneticky stromy

fylogenetický strom ukazuje evolučné vzťahy medzi rôznymi druhmi . Každý " uzol " na strome predstavuje vznik nového druhu , a ak je dva druhy môžu vystopovať ich pôvod späť do jedného uzla , tento uzol predstavuje najnovší bod v čase , že tieto dva druhy zdieľaný spoločný predok . Tieto stromy sú konštruované na základe fyzických a genetických vlastnostiach , a evolučnej biológovia sú často nútení zmeniť , ak nové dáta prichádza na svetlo .
Borrelia

Borrelia je vlastne rod baktérií , ktoré obsahuje viac druhov . Počet druhov Borrelia zvýšil niekoľkokrát v priebehu posledných dvoch desaťročí , ako boli identifikované ďalšie kmene . Definícia druhov borélií či iných rodov baktérií je v skutočnosti veľmi zradné problém . Kde sa obávajú , rastliny a zvieratá , biológovia už tradične definované druhy na základe ich neschopnosť správať a produkovať úrodná potomstva . Kôň a somár môže správať , napríklad , ale mulica , že výsledky je sterilný , takže kone a somáre sú samostatné druhy . Baktérie však množia asexuálne , tak táto definícia je irelevantné . V dôsledku toho , pre borélie a pre mnoho iných baktérií , mikrobiológov definovať druhy rozdiel založený na technike zvanej celá DNA - DNA hybridizácie .
Vzťahy

Vedci majú postavené fylogeneticky stromy pre Borrelia druhu na základe techniku ​​zvanú multilokusová sekvenčná analýza ( MPSV ) , ktorý sa zameriava na rozdiely medzi špecifickou " upratovanie " prítomné vo všetkých rôznych druhov génov . Biológovia používajú tento softvér na vytvorenie " najviac šetrný strom " - Fylogeneticky strom , ktorý vyžaduje najmenší počet evolučných zmien , na vysvetlenie pozorovaných rozdielov . Výsledky tejto metódy , ale často je potrebné zlepšiť , keď k dispozícii nové informácie .
Vzťahy

V súčasnej dobe , B. burgdorferi sensu stricto zdieľa svoj ​​najnovší spoločný predok s B. bissettii; títo dvaja zase zdieľajú spoločný predok s B. lusitaniae . Všetky tri druhy sa líšili od spoločného predka , ktoré zdieľajú s B. Afzelia , B. spielmanii , B. garinii a B. bavariensis . Táto skupina druhov potom sa líšil od spoločného predka zdieľané s B. valaisiana . To je dôležité pre poznámku , však, že tento fylogenetický strom by mohla veľmi dobre zmeniť v budúcnosti ako nové dáta prichádza na svetlo . Zvlášť , to je celkom možné , že klesajúci náklady na sekvenovanie genómu by mohla mať vplyv na spôsob , akým sú fylogeneticky stromy vyvinutý pre baktérie , ako je B. burgdorferi .